科研院所的管理体制，既要符合一般公共机构的特点和定位，又要遵循创新规律，建立具有充分自主性、灵活性、能够有效激发创新动力和活力的运行机制和管理方式，以及适应团队作战和科研任务攻关特点的科研经费支持方式。

政府属科研院所一般因公共目的而设立，主要由政府资助，其研发活动和科研任务具有很强的公共性、战略性和综合性，在服务国家战略目标和支撑政府履行职能方面发挥主体和骨干作用。

从我国的国家创新体系格局来看，政府属科研院所应在强化国家战略科技力量、实现科技自立自强中发挥更大作用。

政府属科研院所具有与一般事业单位、高校、企业等其他创新主体不同的特征。一是普遍以科技创新为主业，高层次科技人才和创造性活动密集，成果产出周期长、不确定性大；二是多以完成科技任务为导向，学科发展常融于研发活动，具有以任务带学科、带人才培养的鲜明特色；三是擅长团队作战和任务攻关，在应用基础研究和共性技术攻关方面具有组织优势；四是既紧贴行业又紧靠科技前沿，具有行业共性技术创新平台的特征和优势，有利于有效连接行业需求与创新资源，实现研发活动与产业应用、公共服务等的融合及互相促动。

基于上述特点，其管理体制既要符合一般公共机构的特点和定位，由政府提供相对稳定、可持续的经费和条件保障，以履行职责、完成使命；又要遵循创新规律，建立具有充分自主性、灵活性、能够有效激发创新动力和活力的运行机制和管理方式，以及适应团队作战和科研任务攻关特点的科研经费支持方式。

20世纪80年代以来，一些发达国家纷纷改革和重组科研机构以提高创新活力，它们对科研机构的管理有不少共性。

一是力求按照科研机构的特点和定位，建立特有的管理制度并以法律法规形式予以保证，甚至实行“一所一法”“一所一策”，如美国的“国立卫生研究院法”“国家标准技术研究院法”等。

二是政府会为科研机构提供较为充足、稳定的经费支持。例如，英、美、德、日等国家的国立研究机构基本都以国家财政投入为主，并且对于重点领域机构集中投入。

三是面对不断加剧的全球经济与科技竞争，一些国家在某些重要领域新建或强化了对卓越科研机构的支持。例如，日本在1999年开始推行独立行政法人化改革之后，2015年再次改革，又将31个独立行政法人科研机构改为“国立研究开发法人”，单独制定适合研究开发规律的管理制度。2016年，日本出台《关于促进特定国立研究开发法人研究开发等的特别措施法》，又将一些特定领域的卓越科研机构改为“特定国立研究开发法人”，给予特殊支持，以强化研究机构在前沿技术研究和应用中的地位和作用，最大程度释放创新活力，促进产出世界最高水平的成果。

改革开放以来，我国政府属科研院所不断改革创新，获得长足发展，创新能力、公共服务意识和水平、对经济社会发展的支撑引领作用等都得到显著提升。面对国内外新的形势与挑战，我国应充分借鉴国内外先进经验，继续深化改革、探索创新，走出一条具有自己特色和优势的高水平科研院所建设之路。特别是有实力、高水平的科研院所，更应站在国家战略高度，围绕国家重大需求和战略科技力量建设，进一步凝练使命定位，释放创新活力，与高校、企业等形成分工合作、协同互补的战略合力，为我国建设创新型国家和世界科技强国、实现高水平科技自立自强提供强有力支撑。

科学确定政府属科研院所的职能定位、探索建立新的适合其特点和使命定位的基本管理框架，应成为下一步科研院所改革的一项基础性、核心性工作。